第二临床医学院学生会是在第二临床医学院团委老师指导下，学生自主管理，为同学们服务的学生组织。学生会是同学与老师之间沟通交流的桥梁，是以团结和带领广大同学在学习和实践中成长、成才为目标，同时给予学生更多锻炼机会的学生团队。
同时，第二临床医学院学生会作为学院联系广大学生的群众性组织，在优化育人环境、促进青年成才，维护学校安定团结，维护广大同学的正当权益与要求等方面起着重要作用。 第二临床医学院学生会由八个部门组成，分别为办公室、学习部、体育部、宣传部、文艺部、外联部、女生部、自律部，同时建立了艺术团，礼仪队，化妆队，辩论队等，并按照需要划归院学生会各相关部门管理。 1.办公室以“协调沟通，服务群众”为宗旨，其主要任务是维持学生会日常运作，传递信息和会议通知，完成资料整理、文件起草、简报编写、物品管理、财务报销等。办公室作为主席团直属的一个下设部门，是联系主席团和各部门的桥梁，更是学生会的枢纽部门。
2.学习部以“促进学风建设、活跃学术氛围”为宗旨，其主要任务是主办院级或承办校级各类辩论赛、优秀校友及医生交流讲座、征文比赛等活动，管理学院辩论队日常训练等。其品牌活动有未来医师精英挑战赛、临床综合技能竞赛等。
3.体育部以“全民健康，弘扬体育精神”为宗旨，其主要任务是管理学院球队，组织同学参加学校各项体育赛事，如：“新生杯”三大球赛（男篮、男足、女排）、“文明杯”男子篮球赛、校运动会、校乒乓球锦标赛、太极段位赛、天使杯女篮邀请赛、男女混排比赛等。此外，体育部也主办院内体育赛事，如：趣味运动会、班级篮球赛等。
4.宣传部以“活动导向，宣传风采”为宗旨，其主要任务是负责学院各类活动的场地布置、海报绘制、道具制作以及协助其他部门进行宣传工作，提高学院各项学生活动的影响力。
5.文艺部以“展现精彩自我，弘扬校园文化”为宗旨，其主要任务是组织策划学院各类文娱活动，丰富广大同学课余文化生活，繁荣校园文化，发掘文娱人才，增强文娱氛围等，是一个极赋活力与凝聚力的部门。
6.外联部以“立足院内，走向校外，实践自我”为宗旨，其主要任务是加强院商合作，向外展示学院学生风采，努力提高学生会在各方面的影响力，为学生活动筹备资金，推动学院学生活动更加顺利地开展。
7.女生部以“服务女生，关爱女生，展现女生风采”为宗旨，其主要任务是强化女生自尊、自强、自主、自立意识，促进男女生之间的交流与沟通，组织开展有利于女生身心健康的文体活动。同时，女生部兼管礼仪队与化妆队的日常训练和管理工作。
8.自律部以“服务育人，监察学风建设”为宗旨，其主要任务是督查院学生寝室文明，考核院团委学生会干部及干事工作，举办学院寝室美化大赛，保障学院学生会各项活动顺利进行。同时，协助校级组织进行相关工作，如校园淘宝活动等。
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